Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms