Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
GAPVD1Q14C86 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GAPVD1Q14C86 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GAPVD1Q14C86 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GAPVD1Q14C86 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GAPVD1Q14C86 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GAPVD1Q14C86 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GAPVD1Q14C86 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GAPVD1Q14C86 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GAPVD1Q14C86 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GAPVD1Q14C86 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
GAPVD1Q14C86 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GAPVD1Q14C86 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GAPVD1Q14C86 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GAPVD1Q14C86 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GAPVD1Q14C86 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GAPVD1Q14C86 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GAPVD1Q14C86 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GAPVD1Q14C86 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GAPVD1Q14C86 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GAPVD1Q14C86 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
GAPVD1Q14C86 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
GAPVD1Q14C86 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GAPVD1Q14C86 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GAPVD1Q14C86 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GAPVD1Q14C86 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GAPVD1Q14C86 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GAPVD1Q14C86 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GAPVD1Q14C86 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GAPVD1Q14C86 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
GAPVD1Q14C86 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GAPVD1Q14C86 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GAPVD1Q14C86 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GAPVD1Q14C86 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GAPVD1Q14C86 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GAPVD1Q14C86 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GAPVD1Q14C86 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GAPVD1Q14C86 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GAPVD1Q14C86 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GAPVD1Q14C86 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
GAPVD1Q14C86 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GAPVD1Q14C86 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GAPVD1Q14C86 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GAPVD1Q14C86 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GAPVD1Q14C86 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GAPVD1Q14C86 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GAPVD1Q14C86 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GAPVD1Q14C86 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
GAPVD1Q14C86 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
GAPVD1Q14C86 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
GAPVD1Q14C86 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
GAPVD1Q14C86 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
GAPVD1Q14C86 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
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