Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms