Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
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