Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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