Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IHHQ14623 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IHHQ14623 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IHHQ14623 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IHHQ14623 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IHHQ14623 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IHHQ14623 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IHHQ14623 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IHHQ14623 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IHHQ14623 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IHHQ14623 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IHHQ14623 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IHHQ14623 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IHHQ14623 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
IHHQ14623 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IHHQ14623 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IHHQ14623 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IHHQ14623 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IHHQ14623 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IHHQ14623 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IHHQ14623 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IHHQ14623 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IHHQ14623 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IHHQ14623 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IHHQ14623 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IHHQ14623 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IHHQ14623 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IHHQ14623 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IHHQ14623 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IHHQ14623 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IHHQ14623 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IHHQ14623 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IHHQ14623 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IHHQ14623 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IHHQ14623 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IHHQ14623 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IHHQ14623 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IHHQ14623 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IHHQ14623 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IHHQ14623 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
IHHQ14623 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IHHQ14623 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IHHQ14623 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IHHQ14623 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IHHQ14623 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IHHQ14623 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IHHQ14623 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IHHQ14623 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IHHQ14623 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IHHQ14623 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IHHQ14623 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IHHQ14623 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IHHQ14623 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IHHQ14623 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IHHQ14623 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
IHHQ14623 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IHHQ14623 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IHHQ14623 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IHHQ14623 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IHHQ14623 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IHHQ14623 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IHHQ14623 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IHHQ14623 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IHHQ14623 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IHHQ14623 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IHHQ14623 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
IHHQ14623 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IHHQ14623 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IHHQ14623 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IHHQ14623 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IHHQ14623 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
IHHQ14623 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IHHQ14623 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IHHQ14623 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IHHQ14623 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IHHQ14623 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IHHQ14623 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IHHQ14623 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IHHQ14623 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IHHQ14623 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IHHQ14623 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IHHQ14623 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IHHQ14623 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IHHQ14623 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IHHQ14623 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IHHQ14623 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IHHQ14623 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IHHQ14623 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IHHQ14623 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IHHQ14623 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IHHQ14623 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IHHQ14623 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
IHHQ14623 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IHHQ14623 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IHHQ14623 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IHHQ14623 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IHHQ14623 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
IHHQ14623 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IHHQ14623 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IHHQ14623 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms