Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
EBI3Q14213 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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