Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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