Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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