Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
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CUL3Q13618 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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CUL3Q13618 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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CUL3Q13618 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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CUL3Q13618 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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CUL3Q13618 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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CUL3Q13618 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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CUL3Q13618 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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