Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NAE1Q13564 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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