Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
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