Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

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Length 652 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PICALMQ13492 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PICALMQ13492 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PICALMQ13492 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PICALMQ13492 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
PICALMQ13492 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PICALMQ13492 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PICALMQ13492 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PICALMQ13492 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PICALMQ13492 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PICALMQ13492 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PICALMQ13492 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
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PICALMQ13492 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
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PICALMQ13492 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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PICALMQ13492 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
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