Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
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