Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TCOF1Q13428 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TCOF1Q13428 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TCOF1Q13428 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TCOF1Q13428 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TCOF1Q13428 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TCOF1Q13428 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TCOF1Q13428 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TCOF1Q13428 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TCOF1Q13428 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TCOF1Q13428 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TCOF1Q13428 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TCOF1Q13428 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TCOF1Q13428 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TCOF1Q13428 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TCOF1Q13428 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TCOF1Q13428 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TCOF1Q13428 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TCOF1Q13428 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TCOF1Q13428 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TCOF1Q13428 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TCOF1Q13428 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TCOF1Q13428 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TCOF1Q13428 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TCOF1Q13428 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TCOF1Q13428 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TCOF1Q13428 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TCOF1Q13428 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TCOF1Q13428 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TCOF1Q13428 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TCOF1Q13428 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TCOF1Q13428 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TCOF1Q13428 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TCOF1Q13428 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TCOF1Q13428 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TCOF1Q13428 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TCOF1Q13428 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TCOF1Q13428 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TCOF1Q13428 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TCOF1Q13428 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TCOF1Q13428 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TCOF1Q13428 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TCOF1Q13428 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TCOF1Q13428 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TCOF1Q13428 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TCOF1Q13428 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TCOF1Q13428 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TCOF1Q13428 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TCOF1Q13428 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TCOF1Q13428 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TCOF1Q13428 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TCOF1Q13428 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TCOF1Q13428 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TCOF1Q13428 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TCOF1Q13428 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TCOF1Q13428 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TCOF1Q13428 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TCOF1Q13428 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TCOF1Q13428 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TCOF1Q13428 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TCOF1Q13428 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TCOF1Q13428 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TCOF1Q13428 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TCOF1Q13428 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TCOF1Q13428 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TCOF1Q13428 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TCOF1Q13428 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TCOF1Q13428 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TCOF1Q13428 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TCOF1Q13428 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TCOF1Q13428 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TCOF1Q13428 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TCOF1Q13428 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TCOF1Q13428 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TCOF1Q13428 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TCOF1Q13428 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TCOF1Q13428 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TCOF1Q13428 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TCOF1Q13428 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TCOF1Q13428 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
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