Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms