Protein–RNA interactions for Protein: Q13363

CTBP1, C-terminal-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP1Q13363 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTBP1Q13363 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTBP1Q13363 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTBP1Q13363 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTBP1Q13363 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTBP1Q13363 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTBP1Q13363 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTBP1Q13363 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTBP1Q13363 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTBP1Q13363 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTBP1Q13363 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTBP1Q13363 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTBP1Q13363 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTBP1Q13363 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTBP1Q13363 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CTBP1Q13363 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CTBP1Q13363 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTBP1Q13363 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTBP1Q13363 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTBP1Q13363 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTBP1Q13363 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTBP1Q13363 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTBP1Q13363 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTBP1Q13363 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTBP1Q13363 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTBP1Q13363 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTBP1Q13363 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTBP1Q13363 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTBP1Q13363 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTBP1Q13363 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTBP1Q13363 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTBP1Q13363 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTBP1Q13363 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTBP1Q13363 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTBP1Q13363 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CTBP1Q13363 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTBP1Q13363 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTBP1Q13363 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTBP1Q13363 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTBP1Q13363 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTBP1Q13363 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTBP1Q13363 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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CTBP1Q13363 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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CTBP1Q13363 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTBP1Q13363 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTBP1Q13363 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
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CTBP1Q13363 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTBP1Q13363 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTBP1Q13363 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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CTBP1Q13363 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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CTBP1Q13363 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTBP1Q13363 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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CTBP1Q13363 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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CTBP1Q13363 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTBP1Q13363 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTBP1Q13363 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTBP1Q13363 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTBP1Q13363 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTBP1Q13363 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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CTBP1Q13363 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTBP1Q13363 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTBP1Q13363 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTBP1Q13363 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTBP1Q13363 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTBP1Q13363 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CTBP1Q13363 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTBP1Q13363 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTBP1Q13363 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CTBP1Q13363 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CTBP1Q13363 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CTBP1Q13363 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CTBP1Q13363 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CTBP1Q13363 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTBP1Q13363 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTBP1Q13363 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CTBP1Q13363 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTBP1Q13363 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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