Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms