Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms