Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms