Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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