Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
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