Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
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IFT88Q13099 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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