Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms