Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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