Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
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