Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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