Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

Predictions only

Length 1,436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NUP160Q12769 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NUP160Q12769 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NUP160Q12769 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NUP160Q12769 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NUP160Q12769 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NUP160Q12769 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NUP160Q12769 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms