Protein–RNA interactions for Protein: Q10587

TEF, Thyrotroph embryonic factor, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TEFQ10587 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TEFQ10587 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TEFQ10587 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TEFQ10587 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TEFQ10587 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TEFQ10587 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TEFQ10587 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TEFQ10587 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TEFQ10587 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TEFQ10587 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TEFQ10587 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TEFQ10587 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TEFQ10587 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TEFQ10587 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TEFQ10587 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TEFQ10587 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TEFQ10587 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TEFQ10587 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TEFQ10587 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TEFQ10587 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TEFQ10587 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TEFQ10587 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TEFQ10587 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TEFQ10587 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TEFQ10587 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TEFQ10587 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TEFQ10587 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TEFQ10587 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TEFQ10587 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TEFQ10587 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TEFQ10587 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TEFQ10587 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TEFQ10587 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TEFQ10587 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TEFQ10587 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TEFQ10587 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TEFQ10587 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TEFQ10587 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TEFQ10587 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TEFQ10587 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TEFQ10587 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TEFQ10587 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TEFQ10587 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TEFQ10587 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TEFQ10587 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TEFQ10587 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TEFQ10587 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TEFQ10587 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TEFQ10587 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TEFQ10587 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TEFQ10587 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TEFQ10587 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TEFQ10587 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TEFQ10587 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TEFQ10587 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TEFQ10587 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TEFQ10587 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TEFQ10587 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TEFQ10587 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TEFQ10587 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TEFQ10587 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TEFQ10587 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TEFQ10587 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TEFQ10587 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TEFQ10587 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TEFQ10587 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TEFQ10587 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TEFQ10587 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TEFQ10587 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TEFQ10587 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TEFQ10587 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TEFQ10587 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TEFQ10587 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TEFQ10587 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TEFQ10587 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TEFQ10587 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TEFQ10587 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TEFQ10587 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TEFQ10587 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TEFQ10587 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TEFQ10587 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TEFQ10587 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TEFQ10587 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TEFQ10587 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TEFQ10587 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TEFQ10587 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TEFQ10587 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TEFQ10587 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TEFQ10587 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TEFQ10587 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TEFQ10587 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TEFQ10587 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TEFQ10587 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TEFQ10587 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TEFQ10587 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TEFQ10587 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TEFQ10587 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TEFQ10587 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TEFQ10587 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TEFQ10587 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms