Protein–RNA interactions for Protein: Q10472

GALNT1, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALNT1Q10472 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GALNT1Q10472 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
GALNT1Q10472 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
GALNT1Q10472 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
GALNT1Q10472 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
GALNT1Q10472 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
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