Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms