Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms