Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms