Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC30.4■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
ERCC6Q03468 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ERCC6Q03468 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ERCC6Q03468 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ERCC6Q03468 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
ERCC6Q03468 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ERCC6Q03468 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ERCC6Q03468 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ERCC6Q03468 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ERCC6Q03468 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ERCC6Q03468 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ERCC6Q03468 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ERCC6Q03468 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ERCC6Q03468 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ERCC6Q03468 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ERCC6Q03468 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ERCC6Q03468 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ERCC6Q03468 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ERCC6Q03468 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ERCC6Q03468 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ERCC6Q03468 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ERCC6Q03468 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ERCC6Q03468 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ERCC6Q03468 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ERCC6Q03468 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ERCC6Q03468 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ERCC6Q03468 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ERCC6Q03468 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ERCC6Q03468 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ERCC6Q03468 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ERCC6Q03468 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ERCC6Q03468 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
ERCC6Q03468 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ERCC6Q03468 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ERCC6Q03468 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ERCC6Q03468 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ERCC6Q03468 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ERCC6Q03468 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ERCC6Q03468 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ERCC6Q03468 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ERCC6Q03468 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
ERCC6Q03468 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ERCC6Q03468 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ERCC6Q03468 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ERCC6Q03468 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
ERCC6Q03468 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ERCC6Q03468 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
ERCC6Q03468 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
ERCC6Q03468 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
ERCC6Q03468 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
ERCC6Q03468 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ERCC6Q03468 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
ERCC6Q03468 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
ERCC6Q03468 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ERCC6Q03468 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
ERCC6Q03468 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
ERCC6Q03468 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
ERCC6Q03468 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
ERCC6Q03468 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC30.35■■■□□ 2.45
ERCC6Q03468 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
ERCC6Q03468 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
ERCC6Q03468 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ERCC6Q03468 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ERCC6Q03468 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ERCC6Q03468 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ERCC6Q03468 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ERCC6Q03468 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
ERCC6Q03468 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
ERCC6Q03468 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ERCC6Q03468 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ERCC6Q03468 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ERCC6Q03468 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ERCC6Q03468 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
ERCC6Q03468 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
ERCC6Q03468 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
ERCC6Q03468 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
ERCC6Q03468 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
ERCC6Q03468 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
ERCC6Q03468 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms