Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms