Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2BQ00403 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2BQ00403 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2BQ00403 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2BQ00403 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2BQ00403 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2BQ00403 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2BQ00403 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2BQ00403 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2BQ00403 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2BQ00403 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2BQ00403 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2BQ00403 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2BQ00403 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2BQ00403 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2BQ00403 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2BQ00403 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2BQ00403 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2BQ00403 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2BQ00403 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2BQ00403 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2BQ00403 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2BQ00403 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2BQ00403 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2BQ00403 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2BQ00403 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2BQ00403 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2BQ00403 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2BQ00403 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2BQ00403 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2BQ00403 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2BQ00403 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2BQ00403 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2BQ00403 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2BQ00403 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2BQ00403 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2BQ00403 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2BQ00403 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2BQ00403 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2BQ00403 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2BQ00403 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2BQ00403 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2BQ00403 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2BQ00403 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2BQ00403 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2BQ00403 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2BQ00403 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2BQ00403 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2BQ00403 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2BQ00403 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GTF2BQ00403 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GTF2BQ00403 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GTF2BQ00403 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GTF2BQ00403 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GTF2BQ00403 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GTF2BQ00403 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GTF2BQ00403 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2BQ00403 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms