Protein–RNA interactions for Protein: Q00056

HOXA4, Homeobox protein Hox-A4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4Q00056 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXA4Q00056 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXA4Q00056 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXA4Q00056 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXA4Q00056 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXA4Q00056 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXA4Q00056 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA4Q00056 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms