Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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