Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms