Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BP2P78314 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BP2P78314 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BP2P78314 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BP2P78314 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BP2P78314 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BP2P78314 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BP2P78314 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BP2P78314 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BP2P78314 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BP2P78314 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BP2P78314 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BP2P78314 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BP2P78314 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BP2P78314 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BP2P78314 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BP2P78314 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BP2P78314 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BP2P78314 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BP2P78314 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BP2P78314 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BP2P78314 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BP2P78314 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BP2P78314 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BP2P78314 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BP2P78314 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BP2P78314 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BP2P78314 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BP2P78314 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SH3BP2P78314 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SH3BP2P78314 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SH3BP2P78314 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SH3BP2P78314 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SH3BP2P78314 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SH3BP2P78314 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SH3BP2P78314 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SH3BP2P78314 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SH3BP2P78314 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SH3BP2P78314 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SH3BP2P78314 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SH3BP2P78314 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SH3BP2P78314 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SH3BP2P78314 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SH3BP2P78314 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SH3BP2P78314 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SH3BP2P78314 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SH3BP2P78314 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SH3BP2P78314 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SH3BP2P78314 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SH3BP2P78314 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SH3BP2P78314 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SH3BP2P78314 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SH3BP2P78314 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SH3BP2P78314 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SH3BP2P78314 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SH3BP2P78314 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SH3BP2P78314 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SH3BP2P78314 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SH3BP2P78314 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SH3BP2P78314 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SH3BP2P78314 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SH3BP2P78314 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SH3BP2P78314 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SH3BP2P78314 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BP2P78314 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BP2P78314 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BP2P78314 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BP2P78314 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BP2P78314 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BP2P78314 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BP2P78314 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BP2P78314 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BP2P78314 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BP2P78314 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BP2P78314 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BP2P78314 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BP2P78314 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BP2P78314 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BP2P78314 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BP2P78314 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BP2P78314 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BP2P78314 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BP2P78314 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BP2P78314 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BP2P78314 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BP2P78314 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BP2P78314 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BP2P78314 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BP2P78314 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BP2P78314 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BP2P78314 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BP2P78314 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BP2P78314 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BP2P78314 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BP2P78314 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BP2P78314 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BP2P78314 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BP2P78314 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BP2P78314 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BP2P78314 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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