Protein–RNA interactions for Protein: P62701

RPS4X, 40S ribosomal protein S4, X isoform, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4XP62701 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms