Protein–RNA interactions for Protein: P62136

PPP1CA, Serine/threonine-protein phosphatase PP1-alpha catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CAP62136 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1CAP62136 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms