Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVK-21P61565 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVK-21P61565 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVK-21P61565 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVK-21P61565 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVK-21P61565 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVK-21P61565 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVK-21P61565 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVK-21P61565 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVK-21P61565 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVK-21P61565 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVK-21P61565 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVK-21P61565 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVK-21P61565 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVK-21P61565 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVK-21P61565 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVK-21P61565 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK-21P61565 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK-21P61565 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK-21P61565 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK-21P61565 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK-21P61565 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK-21P61565 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK-21P61565 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK-21P61565 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK-21P61565 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK-21P61565 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK-21P61565 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK-21P61565 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK-21P61565 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK-21P61565 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK-21P61565 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK-21P61565 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK-21P61565 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK-21P61565 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK-21P61565 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK-21P61565 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK-21P61565 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK-21P61565 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK-21P61565 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK-21P61565 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK-21P61565 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK-21P61565 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK-21P61565 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK-21P61565 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK-21P61565 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVK-21P61565 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVK-21P61565 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVK-21P61565 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVK-21P61565 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVK-21P61565 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVK-21P61565 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVK-21P61565 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVK-21P61565 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVK-21P61565 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVK-21P61565 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVK-21P61565 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVK-21P61565 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVK-21P61565 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVK-21P61565 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVK-21P61565 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVK-21P61565 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVK-21P61565 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVK-21P61565 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVK-21P61565 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVK-21P61565 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVK-21P61565 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVK-21P61565 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVK-21P61565 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVK-21P61565 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVK-21P61565 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVK-21P61565 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVK-21P61565 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVK-21P61565 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVK-21P61565 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVK-21P61565 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVK-21P61565 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVK-21P61565 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVK-21P61565 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVK-21P61565 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVK-21P61565 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVK-21P61565 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVK-21P61565 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVK-21P61565 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVK-21P61565 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVK-21P61565 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVK-21P61565 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVK-21P61565 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVK-21P61565 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVK-21P61565 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVK-21P61565 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVK-21P61565 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVK-21P61565 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVK-21P61565 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVK-21P61565 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVK-21P61565 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVK-21P61565 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVK-21P61565 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVK-21P61565 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVK-21P61565 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms