Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVS71-1P61550 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms