Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms