Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTBP60709 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTBP60709 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTBP60709 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTBP60709 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTBP60709 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTBP60709 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTBP60709 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTBP60709 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTBP60709 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTBP60709 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTBP60709 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTBP60709 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTBP60709 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTBP60709 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTBP60709 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTBP60709 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTBP60709 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTBP60709 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTBP60709 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTBP60709 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTBP60709 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTBP60709 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTBP60709 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTBP60709 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTBP60709 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTBP60709 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTBP60709 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTBP60709 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTBP60709 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTBP60709 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTBP60709 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTBP60709 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTBP60709 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTBP60709 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTBP60709 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTBP60709 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTBP60709 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTBP60709 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTBP60709 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTBP60709 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTBP60709 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTBP60709 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTBP60709 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTBP60709 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTBP60709 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTBP60709 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTBP60709 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTBP60709 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTBP60709 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACTBP60709 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
ACTBP60709 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACTBP60709 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACTBP60709 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACTBP60709 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACTBP60709 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTBP60709 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTBP60709 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTBP60709 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTBP60709 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTBP60709 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTBP60709 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTBP60709 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTBP60709 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTBP60709 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTBP60709 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTBP60709 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTBP60709 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTBP60709 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTBP60709 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTBP60709 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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ACTBP60709 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTBP60709 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTBP60709 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTBP60709 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTBP60709 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTBP60709 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTBP60709 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTBP60709 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTBP60709 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTBP60709 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTBP60709 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTBP60709 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTBP60709 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTBP60709 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTBP60709 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTBP60709 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTBP60709 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTBP60709 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTBP60709 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTBP60709 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTBP60709 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTBP60709 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTBP60709 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTBP60709 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTBP60709 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTBP60709 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTBP60709 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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