Protein–RNA interactions for Protein: P56278

MTCP1, Protein p13 MTCP-1, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTCP1P56278 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms