Protein–RNA interactions for Protein: P55212

CASP6, Caspase-6, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP6P55212 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP6P55212 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP6P55212 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP6P55212 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP6P55212 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP6P55212 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP6P55212 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP6P55212 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP6P55212 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP6P55212 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP6P55212 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP6P55212 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP6P55212 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP6P55212 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP6P55212 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP6P55212 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP6P55212 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP6P55212 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP6P55212 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP6P55212 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP6P55212 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP6P55212 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP6P55212 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP6P55212 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP6P55212 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP6P55212 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP6P55212 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP6P55212 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP6P55212 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP6P55212 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP6P55212 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP6P55212 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP6P55212 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP6P55212 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP6P55212 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP6P55212 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP6P55212 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP6P55212 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP6P55212 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP6P55212 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP6P55212 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP6P55212 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP6P55212 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP6P55212 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP6P55212 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP6P55212 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP6P55212 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP6P55212 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP6P55212 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP6P55212 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP6P55212 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP6P55212 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP6P55212 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP6P55212 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP6P55212 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP6P55212 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP6P55212 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP6P55212 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP6P55212 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP6P55212 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP6P55212 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP6P55212 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP6P55212 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP6P55212 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP6P55212 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP6P55212 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP6P55212 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP6P55212 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP6P55212 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP6P55212 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP6P55212 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP6P55212 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP6P55212 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP6P55212 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP6P55212 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP6P55212 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP6P55212 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP6P55212 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP6P55212 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP6P55212 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP6P55212 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP6P55212 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP6P55212 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP6P55212 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP6P55212 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP6P55212 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP6P55212 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP6P55212 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP6P55212 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP6P55212 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP6P55212 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP6P55212 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP6P55212 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP6P55212 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP6P55212 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP6P55212 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP6P55212 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP6P55212 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP6P55212 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP6P55212 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms