Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BCAMP50895 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BCAMP50895 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BCAMP50895 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BCAMP50895 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BCAMP50895 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BCAMP50895 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BCAMP50895 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BCAMP50895 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BCAMP50895 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BCAMP50895 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BCAMP50895 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BCAMP50895 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BCAMP50895 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BCAMP50895 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
BCAMP50895 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BCAMP50895 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BCAMP50895 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BCAMP50895 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BCAMP50895 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BCAMP50895 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BCAMP50895 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BCAMP50895 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BCAMP50895 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BCAMP50895 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BCAMP50895 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BCAMP50895 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BCAMP50895 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BCAMP50895 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BCAMP50895 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BCAMP50895 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BCAMP50895 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BCAMP50895 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BCAMP50895 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BCAMP50895 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BCAMP50895 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BCAMP50895 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BCAMP50895 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BCAMP50895 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.07
BCAMP50895 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
BCAMP50895 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BCAMP50895 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BCAMP50895 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BCAMP50895 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BCAMP50895 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BCAMP50895 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BCAMP50895 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BCAMP50895 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BCAMP50895 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BCAMP50895 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BCAMP50895 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BCAMP50895 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
BCAMP50895 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BCAMP50895 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
BCAMP50895 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
BCAMP50895 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
BCAMP50895 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BCAMP50895 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BCAMP50895 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BCAMP50895 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BCAMP50895 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BCAMP50895 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BCAMP50895 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BCAMP50895 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BCAMP50895 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BCAMP50895 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BCAMP50895 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BCAMP50895 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BCAMP50895 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BCAMP50895 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BCAMP50895 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
BCAMP50895 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BCAMP50895 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BCAMP50895 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BCAMP50895 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BCAMP50895 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BCAMP50895 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BCAMP50895 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BCAMP50895 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BCAMP50895 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BCAMP50895 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BCAMP50895 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BCAMP50895 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BCAMP50895 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BCAMP50895 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BCAMP50895 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BCAMP50895 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BCAMP50895 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BCAMP50895 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
BCAMP50895 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BCAMP50895 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BCAMP50895 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
BCAMP50895 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BCAMP50895 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BCAMP50895 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BCAMP50895 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BCAMP50895 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BCAMP50895 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BCAMP50895 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BCAMP50895 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms