Protein–RNA interactions for Protein: P50458

LHX2, LIM/homeobox protein Lhx2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX2P50458 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LHX2P50458 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LHX2P50458 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LHX2P50458 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LHX2P50458 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LHX2P50458 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LHX2P50458 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LHX2P50458 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LHX2P50458 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LHX2P50458 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LHX2P50458 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX2P50458 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX2P50458 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX2P50458 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX2P50458 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX2P50458 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX2P50458 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX2P50458 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX2P50458 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX2P50458 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX2P50458 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX2P50458 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX2P50458 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX2P50458 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX2P50458 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX2P50458 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX2P50458 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX2P50458 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX2P50458 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX2P50458 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX2P50458 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX2P50458 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX2P50458 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX2P50458 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX2P50458 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX2P50458 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX2P50458 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX2P50458 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX2P50458 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX2P50458 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX2P50458 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX2P50458 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX2P50458 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX2P50458 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX2P50458 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX2P50458 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX2P50458 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX2P50458 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX2P50458 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX2P50458 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX2P50458 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX2P50458 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LHX2P50458 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LHX2P50458 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LHX2P50458 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LHX2P50458 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LHX2P50458 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LHX2P50458 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LHX2P50458 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LHX2P50458 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LHX2P50458 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LHX2P50458 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LHX2P50458 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LHX2P50458 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LHX2P50458 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
LHX2P50458 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LHX2P50458 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LHX2P50458 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LHX2P50458 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LHX2P50458 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LHX2P50458 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LHX2P50458 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LHX2P50458 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LHX2P50458 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LHX2P50458 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LHX2P50458 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LHX2P50458 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LHX2P50458 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LHX2P50458 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LHX2P50458 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LHX2P50458 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LHX2P50458 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LHX2P50458 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LHX2P50458 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LHX2P50458 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LHX2P50458 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LHX2P50458 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LHX2P50458 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LHX2P50458 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX2P50458 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX2P50458 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX2P50458 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX2P50458 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX2P50458 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX2P50458 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX2P50458 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX2P50458 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX2P50458 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX2P50458 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX2P50458 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms